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Structural Basis for a Conserved Neutralization Epitope on the Receptor-binding Domain of SARS-CoV-2
中和SARS-CoV-2病毒受體結合域之保守抗原表位的結構學基礎
Kuan-Ying A. Huang*, Xiaorui Chen, Arpita Mohapatra, Hong Thuy Vy Nguyen, Lisa Schimanski, Tiong Kit Tan, Pramila Rijal, Susan K. Vester, Rory A. Hills, Mark Howarth, Jennifer R. Keeffe, Alexander A. Cohen, LeesaM. Kakutani, Yi-MinWu, Md Shahed-Al-Mahmud, Yu-Chi Chou, Pamela J. Bjorkman, Alain R. Townsend, and Che Ma*
2023/09/07
介由抗體的免疫治療在預防新型冠狀病毒SARS-CoV-2的感染發揮著至關重要的作用。我們從自然感染和疫苗接種的人群中分離出一組可以中和受體結合域（RBD）之抗體。結果顯示它們識別RBD內表面上的一塊免疫原性抗原表位。這些抗體能夠廣泛中和原型武漢株(Wuhan-Hu-1)、Beta和Delta等SARS-CoV-2病毒變異株、甚至其他一些sarbecoviruses（SARS相關病毒）。我們觀察到這些抗體的識別區域從下到上的連續分布在RBD內表面，且部分延伸到受體結合區域。大多數抗體都受到新變異株（Omicron BA.1、BA.2和BA.4/5）的三個突變熱點（S371L/F、S373P和S375F）的嚴重影響。相比之下，有一株抗體IY-2A能夠耐受所有抗原表位的變異、包括sarbecoviruses的對應區域。IY-2A的作用在於它誘導該區域的蛋白結構部分解摺疊，從而創造出一個新的保守的構形抗原表位。這一發現證實抗體識別區域將不僅限於RBD上已知的表面結構。總之，深入了解功能上和結構上保守的RBD抗原表位可望促進防治COVID-19的疫苗與治療藥物之研發。